A Commagny, fut implanté un des plus anciens prieuré du Morvan, qui daterait du VIIe ou VIII e siecle et l’actuelle église Saint-Laurent du XIIe, siège de la paroisse de Commagny. L’abbé Baudiau rapporte qu’une chapelle (ou cella) fut érigée sur les terres de Commagny au VIIe siècle. L’abbaye (voir fiche prieuré) semblait déjà importante au IXe siècle. Elle posséda de nombreux fiefs et seigneurie qui lui apportait de conséquents revenus. Il fallut pourtant attendre le XIIe siècle pour que soit construite cette église prieurale (qui supplanta peut-etre la chapelle plus ancienne). D’abord placée sous le vocable de saint-Hilaire, elle devint Saint-Laurent au XIVe siècle tandis qu’était bâtie la maison du prieur. Elle fut une église prieurale et paroissiale. Elle ne subit pas – ou fort peu – de remaniements aux cours des époques qui suivirent, sinon d’ordre mobilier : installation d’un autel au décor trilobé au XVe siècle, d’une chaire en XVIIe siècle, etc... avant d'être vendue comme bien national durant la Révolution. Abandonné et se degradant, en 1898, une tempête endommagea l’édifice ; les réparations furent effectuées grâce à une souscription.
De plan simple, le chœur est composé de l'abside et du transept avec un imposant clocher en forme de tour carré qui précède la nef. L'abside est voûtée en cul-de-four encadrée de deux absidioles, la nef à trois travées est flanquée de deux bas-côtés étroits. Le premier niveau est aveugle, le second percé de baies étroites. Les parois sont hautes et nues. La voûte couvrant la nef, charpentée, est soutenue par des colonnes aux chapiteaux sculptés, simplement décoratifs ou historiés (Daniel dans la fosse aux lions...) La tour-clocher, carrée, est percée de baies en plein-cintre jumelées, séparées par des colonnettes à chapiteaux romans. En façade, on observe la même simplicité, le même dépouillement, par une absence totale d’ornementation. Deux corbeaux soutenaient peut-être la toiture d’un porche. A gauche, les cercueils étaient déposés avant la cérémonie d’enterrement sur une « pierre des morts » encore visible et le cimetière est resté le long de l'église.. En proximité , la fontaine St Gervais état un lieu de vénération pour soigner les coliques ou en période de sécheresse.
L’ensemble de cet édifice de grande qualité, qui a conservé tout son caractère d’origine, a été classé Monument Historique en 1930.